朝起きてぼけーとしながら、brew upgradeをやっていたらgcc49でエラー。よく読んでみると。
Error: gcc49 dependency gmp4 was built with the following C++ standard library: libstdc++ (from clang) This is incompatible with the standard library being used to build gcc49: libc++ (from clang) Please reinstall gmp4 using a compatible compiler. hint: Check https://github.com/mxcl/homebrew/wiki/C++-Standard-Libraries
依存先のgmp4がlibstdc++でビルドされているけど今使ってるのはlibc++だぜ、ということらしいのでさくっとgmp4をuninstall && installして、再度brew upgrade。今度は無事にupgrade成功したので、よし。